研究代表者
- 2020年度-2021年度 受託研究・超先端材料超高速開発基盤技術プロジェクト（NEDO）「深層学習・転移学習等の適用による材料設計技術の高度化」（代表：再委託 吉田）
- 2019年度-2024年度 受託研究・JST戦略的創造研究推進事業（CREST）熱制御領域「高分子の熱物性マテリアルズインフォマティクス」（JPMJCR19I3）(代表：森川淳子 (東工大); 機械学習・計算科学グループ代表：吉田)
- 2019年度-2024年度 科研費・新学術領域研究（研究領域提案型) 「ハイパーマテリアルのインフォマティクスとhidden orderの探索」（課題番号：19H05820）[科研費補助金データベース]
- 2019年度-2024年度 科研費・基盤研究A 「機械学習の先進技術による革新的機能性物質の発掘」（課題番号：19H01132）[科研費補助金データベース]
- 2015年度-2019年度 受託研究・JSTイノベーションハブ構築支援事業 「情報統合型物質・材料開発イニシアティブ(MI2I）」
- 2015年度-2018年度 科研費・基盤研究B 「ベイズ統計と量子化学を基盤とする新薬候補分子の探索」（課題番号：15H02672）[科研費補助金データベース]
- 2015年度-2016年度 科研費・挑戦的萌芽研究「転写伸長過程の数理モデルとベイズ統計に基づく逆問題解法」（課題番号：15K12145）[科研費補助金データベース]
- 2014年度-2015年度 受託研究・JST戦略的創造研究推進事業（ERATO）佐藤ライブ予測制御プロジェクト 「予測制御アルゴリズムの開発」(代表：佐藤匠徳 (ATR))
- 2014年度-2015年度 受託研究・株式会社地球快適化インスティテュート「分子設計のためのケモインフォマティクス技術の開発」（代表：吉田）
- 2013年度-2014年度 科研費・挑戦的萌芽研究「機械学習に基づく新しい創薬インフォマティクス－医薬品化合物の分子設計」（課題番号：25540015）[科研費補助金データベース]
- 2013年度-2014年度 科研費・新学術領域研究「システムがん」 「第二世代モチーフ解析法に基づくがん細胞に特異的な転写制御経路の発見」（課題番号：25134716）[科研費補助金データベース]
- 2013年度 受託研究・トヨタ自動車株式会社「時系列手法による歩行者遭遇時の運転行動モデリングの研究」（代表：吉田）
- 2012年度-2017年度 受託研究・JST戦略的創造研究推進事業（CREST）生命動態領域 「神経系まるごとの観測データに基づく神経回路の動作特性の解明」(代表：飯野雄一 (東京大学))
- 2011年度-2012年度 科研費・若手研究B 「最先端トランスクリプトーム解析のための統計的バイオモデリング」（課題番号：23700346）[科研費補助金データベース]
- 2009年度-2010年度 科研費・若手研究B 「組織的メタ遺伝子解析の多重検定理論とその応用化」（課題番号：21700313）[科研費補助金データベース]
- 2006年度-2007年度 科研費・若手研究B 「状態空間モデルに基づく高次元時系列データ解析の理論と方法論の研究」（課題番号：18700268）[科研費補助金データベース]
研究分担者
- 2007年度-2013年度 科学技術試験研究委託事業 次世代生命体統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 「生命体シミュレーションのためのデータ同化技術の開発」
- 2007年度-2009年度 JST戦略的創造推進事業（CREST）「先端的データ同化手法と適応型シミュレーションの研究」
- 2006年度-2008年度 科研費・基盤研究B「遺伝子ネットワークによる創薬ターゲットパスウェイのイン・シリコ探索技術」（研究課題番号：18300097）[科研費補助金データベース]
- 2005年度-2008年度 科研費・基盤研究A「階層的統計モデルに基づく異種ゲノム情報の統合手法に関する総合研究」（研究課題番号：17200020) [科研費補助金データベース]
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